PCRで変異株は確認できない これを機にニュースも正確にしてほしい: かじヤンの科学する心

　アルファ株の事をまだ英国型変異とか呼んでた頃ぐらい前々から気になっていた。よく、テレビのニュースなどで「東京都のPCR検査で○○株が△割を占めた」というが、これは間違い。PCR検査では、どの変異株か断定できない。PCRはその変異株に特徴的な変異があるかどうかを確かめているだけ。実際にその株かどうかは国立感染研などで遺伝子解析して初めて決まる。例えば、PCRでアルファ株に特徴的なN501Y変異があっても、同じ変異がベータにもガンマにも（そしてオミクロンにも）あるからどれだか分からない。日本にはベータ、ガンマがほとんど入ってきてないので、ほぼアルファに間違いないと推定はできた。デルタ株に特徴的なL452R変異だって、イータ株（アメリカ由来）やカッパ株（インドの二重変異株）にもあるので見分けがつかない。同様に、都のオミクロン株判別用のPCRが現場に投入されても、本当にオミクロン株かどうか確定するには遺伝子解析が必要。PCRで疑いが出ても、それを感染研などで解析するのにその日のうちには結果が出ない。速報するなら「○○株【とみられる】【の疑いがある】感染者が△割を占めた」と言うべきだ。

◆オミクロン株に独自の判別方法　市中感染の監視へ検査拡充　東京都
https://digital.asahi.com/articles/ASPD3645FPD3UTIL03M.html